Знаю, что для запуска таких файлов команда в терминале — «java -jar», но как можно настроить ассоциацию с этой командой? В Приложениях по умолчанию можно только выбрать из установленных или ввести путь к файлу, в первом случае он просто игнорирует ключ -jar, во втором — не понимает ключ. Потом я ещё пробовал выполнить команду echo «application/x-java-archive=arc» >> /usr/lib/jvm/java-8-openjdk/bin/java -jar и её вариации, что ни к чему не привело.
Зарание спасибо.

Проблема оказалась в нерабочем java, который я переустановил. Потом в Приложениях по умолчанию к формату *.jar добавил запускать java -jar и всё работает!